Речная система области принадлежит к бассейнам Северного Ледовитого и Тихого океанов. Общее количество рек в области около 250 тыс., причем 99% это реки и ручьи длиной менее 10 км.
Распределение рек по бассейнам: бассейн р.Колымы - 178 тыс. рек, бассейн Охотского моря - 68 тыс. рек.